Pondok Pesantren Hidatul Mubtadi-ien adalah merupakan suatu wahana belajar dan mengajar yang menggunakan metode pengajaran dengan menerapkan sistem klasikal yang mempokuskan pada pelajaran pelajaran yang bersifat salafiyah dan sekaligus menjadi ciri khas apondok pesantren. Di samping itu untuk menunjang aktifitas santri dalam memahami dan mengembangkan materi pelajaran, PPHM membentuk forum diskusi yang di kelola oleh majlis musyawarah Hidayatul Mubtadi-ien (MMHM). Forum musyawarah MMHM merupakan suatu upaya untuk meningkatkan kwalitas pendalaman kajian kitab kuning serta hukum – hukum islam, di maksudkan para santri siap dalam mengabdikan diri padaserta dapat menjawab permasalahan – permasalahan yang tumbuh dan berkembang di tengah-tengah masyarakat.